NGS業界の市場規模って，どのくらいなのだろう？この問いに，興味はあっても，具体的な数字は知らなかった。そんなボクがふと，次の文章を読んだところで，驚いてしまった。イルミナの四半期売上が，$266.7 million。これは凄い。単純に４を掛けると，年単位…

SRA には controlled access なデータがあり，それらのデータは，dbGaP（Genotype and Phenotype; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gap）にアクセス許可を申請することでダウンロードができるようだ。dbGaP への申請は，このページからできる：…

久々に SRA からデータをダウンロードしようとしたら，ちょっとしたエラーが出てきた。正確には，ダウンロードのところではなく，sra-lite ファイルから fastq ファイルへ dump するところで。エラーメッセージは，こんな感じ。 fastq-dump -A SRR101400 -M …