SRA
SRA には controlled access なデータがあり,それらのデータは,dbGaP(Genotype and Phenotype; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gap)にアクセス許可を申請することでダウンロードができるようだ。dbGaP への申請は,このページからできる:…
久々に SRA からデータをダウンロードしようとしたら,ちょっとしたエラーが出てきた。正確には,ダウンロードのところではなく,sra-lite ファイルから fastq ファイルへ dump するところで。エラーメッセージは,こんな感じ。 fastq-dump -A SRR101400 -M …