2009-01-01から1年間の記事一覧
jsarticle では，\chapter が使えず，その代わり，\part が使える。 jsarticle を使いたい＆Chapter が使いたいときには，\prepartname を \renewcommand で設定すればよい。 \renewcommand{\prepartname}{Chapter } これだけ。
xdvi で dvi ファイルを開くことができなくなってしまった。。 $ xdvi hoge.dvi & dyld: Library not loaded: /opt/local/lib/libjpeg.62.dylib Referenced from: /opt/local/bin/xdvi-motif Reason: image not found http://blog.iwa-ya.net/2009/12/27/094…
plainnat.bst は，共著者が 3 人以上である場合， Hoge et al. (2009) のように出力してくれる。 この "et al." の部分をイタリックにしたいと思い，plainnat.bst を編集することにした。 $ cp /opt/local/share/texmf-dist/bibtex/bst/natbib/plainnat.bst …
ある人は，負えない責任を負うべきではない，と言う。 ある人は，リスクを取ってでも負うべき責任はある，と言う。どちらも正解になり得て，どちらも不正解になり得る。それが正解だとしても，不正解だとしても。 義理は果たすべきだし，不義理を働いてはい…
BioPAX 形式のネットワークを図示化する必要があったので，色々調べてみた。 BioPAX の図示化に利用可能なソフトウェアの一覧を見つけた Biological software supporting BioPAX http://biopaxwiki.org/cgi-bin/moin.cgi/Biological_software_supporting_Bio…
タイトルなど A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea Dongying Wu et al., Nature (2009) 僕とこの論文の関係 読込度：あっさり（5 段階中 2 番目に低い） 専門性：そこそこある気がする（5 段階中 4 番目に低い） 研究の背景 1…
タイトルなど Novel mutant-selective EGFR kinase inhibitors against EGFR T790M Wenjun Zhou et al., Nature (2009) 僕とこの論文の関係 読込度：とてもあっさり（5 段階中 1 番低い） 専門性：素人（5 段階中 1 番低い） 研究の背景 epidermal growth fa…
logomat-m は，profile HMM で表現されている配列モチーフ情報を，sequence logo の拡張である hmm logo として図示化してくれるソフトウェアである。 論文：HMM Logos for visualization of protein families, BMC Bioinformatics (2004) Web：http://www.s…
この記事は，下記英語サイトを日本語に翻訳したものです。 http://www.assostefano-bambiniemarfan.it/centro_Eng.html医学の専門家ではないので，医学的な専門用語に間違いがあるかもしれませんが，ご容赦いただければ幸いです。 2009 年，遺伝性心臓疾患セ…
今週の Nature からは，3 本の論文を取り上げました。 Novel mutant-selective EGFR kinase inhibitors against EGFR T790M A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea Complex landscapes of somatic rearrangement in human breas…
タイトルなど Complex landscapes of somatic rearrangement in human breast cancer genomes Philip J. Stephens et al., Nature (2009) 僕とこの論文の関係 読込度：比較的あっさり（5 段階中 2 番目に低い） 専門性：初学者（5 段階中 3 番目に低い） 研…
PDL は Perl の言語拡張モジュール。 行列計算などの数値計算や，図示化の機能を拡張してくれているらしい。 Perl で固有値計算をしたいときなどに使えそう。MacBook (Mac OS X 10.5.8) へのインストールを試みた。 $ port search PDL p5-pdl @2.4.3 (perl) …
研究のこととかを書いていこうと思います。
