ターミナルに標準出力する文字列を（部分的に）色づけすると，結果がとても見易くなる。 今までそんなことが可能だと知らずに生きてきてしまったが，Term::ANSIColor モジュールというとても便利なモジュールがあることを知った。 Sample Code 1: testColor.…

日付＆時間の操作を簡易化してくれる Perl module を探したところ，DateTime モジュールを見つけた。 CPAN のページの解説がとても分かりやすい。http://search.cpan.org/~drolsky/DateTime-0.55/lib/DateTime.pm今日の日付を得るためのスクリプト。 use Dat…

logomat-m は，profile HMM で表現されている配列モチーフ情報を，sequence logo の拡張である hmm logo として図示化してくれるソフトウェアである。 論文：HMM Logos for visualization of protein families, BMC Bioinformatics (2004) Web：http://www.s…

PDL は Perl の言語拡張モジュール。 行列計算などの数値計算や，図示化の機能を拡張してくれているらしい。 Perl で固有値計算をしたいときなどに使えそう。MacBook (Mac OS X 10.5.8) へのインストールを試みた。 $ port search PDL p5-pdl @2.4.3 (perl) …