Genome-wide analysis reveals novel molecular features of mouse recombination hotspots | Smagulova et al. Nature 2011 | ChIP-Seq を使って組換えホットスポットを高解像度（200-nucleotide precision）にマッピング

ChIP-Seq で，こんなこともできるのかぁ。と，改めて，そのすごさを実感した論文。

Meiotic recombination is initiated by the introduction of DNA double-stranded breaks (DSBs) by the protein SPO11, followed by resection of the ends to produce long, single-stranded overhangs. Proteins RAD51 and DMC1 form nucleoprotein filaments at the ends of the breaks and search for a homologous chromosome that is used for repair. We used anti-DMC1 antibodies to localize recombination initiation sites in the male mouse genome by chromatin immunoprecipitation followed by high-throughput sequencing (ChIP-Seq).

組換え時に生じる二重鎖切断末端には，RAD51 と DMC1 がくっついている。だから，DMC1 をターゲットにする抗体を使って ChIP-Seq したら，組換えサイトをマッピングできるでしょう。とても単純で，お世辞にもエッジが効いているとは言えないけど，それでも組換えサイトをマッピングできるのだから，パワフルだと思う。

この論文には，さすが Nature に載るだけあって，色々なことが分かったと書いてある。しかし，そこら辺は門外漢の僕にはイマイチ面白さが分からないので，紹介しない。言いたかったことは，ただの１点。「ChIP-Seq で組換えサイトが分かる」。これだけなのだ。